天津新增确诊病例流调疑团(天津确诊患者活动轨迹公布)

天津新增的第137例病例全基因组测序结果是怎样的?
年6月22日从天津市疾控中心获悉,经天津市疾控中心对本市第137例确诊病例呼吸道标本的新冠病毒全基因组高通量测序和序列分析 ,中国疾控中心复核,确认与北京新发地市场相关病例的病毒序列完全相同,属于L基因型欧洲家系分支I 。
月17日 ,天津市新增1例本土新冠肺炎确诊病例,为天津的第137例确诊患者。但奇怪的是,患者未出天津 ,未接触确诊者,无疑似病例和确诊病例接触史。
信息分析:对测序数据进行生物信息分析,包括数据质量控制 、变异检测、基因注释等 ,最终得到全基因组的测序结果 。生物信息分析项目WGS的生物信息分析项目通常包括以下几个方面:变异检测:检测单核苷酸变异(SNV)、插入和缺失(indel) 、拷贝数变异(CNV)和结构变异(SV)等。
高测序深度:可以提高数据的准确性和可信度,减少测序误差和偏差,有助于发现低频突变或变异,提高复杂基因组区域的解析能力。低测序深度:可能导致某些区域的覆盖度不足 ,出现“低覆盖度区域”,从而影响测序结果的准确性和完整性 。
总结高通量测序技术的诞生是基因组学研究领域的一个里程碑事件。该技术使得核酸测序的单碱基成本与第一代测序技术相比急剧下降,但由于数据量的大幅度上升 ,全基因组测序临床应用的瓶颈在于信息的分析和解读能力不足。
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